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基因组实现自动AI建模,华为云助力科研人员探索生命奥秘

在华为开发者大会2020(Cloud)期间,华为云发布全新AutoML工具AutoGenome,支持对基因组数据进行全自动AI建模,助力科研人员探索生命奥秘。

目前,AI技术已经广泛应用在图像、语音等领域,然而在生物医学领域,尤其是基因组学数据领域,AI的应用仍处于初期阶段。主要原因是,由于基因组数据的复杂性,导致主流的基于图像和文本的模型不能很好地对基因组数据进行建模;同时,由于AI模型的搭建开发门槛较高,需要开发者有比较多的经验。

华为云发布的AutoGenome,采用了超参数自动搜索、神经网络架构自动搜索和模型自动解释器等最新的AutoML技术,并且提出了全新的更加适用于基因组数据建模的残差全连接网络,在多项不同的基因组数据建模任务中,AutoGenome的准确性都超出传统模型5个百分点以上。

在开发过程上,AutoGenome对于AI的初学者非常友好,用户在华为云ModelArts一站式AI开发管理平台可以一键启动Notebook开发环境,只需要五行代码即可快速完成端到端的基因组数据建模、准确性评估和模型结束。

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AutoGenome Examples已经列入华为云ModelArts Notebook任务中

此外,华为云还联合华为2012实验室媒体院研发了autosearch自动化搜索框架并预置在华为云一站式AI开发管理平台ModelArts中,可以集成更多的automl搜索算法,便于支持更多的基因建模能力。

大会期间,中科院基因组所韩大力教授也现场分享了如何利用AutoGenome对羟甲基化组学数据进行建模,从而实现对肝癌的诊断。该案例中,借助AutoGenome的自动建模比文献报道的同类工作准确率高出八个百分点。

目前,AutoGenome已经正式上线,用户可在华为云ModelArts一站式AI开发管理平台上使用。

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