九江农业科学院联合中山大学首次发布长江极危物种“鳤”高质量基因组

九江市农业科学院于12月24日宣布,联合中山大学和江西省瑞昌长江四大家鱼原种场,首次完成并发布了长江流域极危物种“鳤”的高质量染色体水平基因组。这一突破性成果为鳤的保护工作提供了重要的科学依据。

鳤曾是我国重要的淡水经济鱼类,广泛分布于长江流域。然而,由于环境恶化和人类活动的影响,其数量急剧下降,被列为极危物种。2020年12月,在长江公安江段监测到了7尾鳤,这是近年来野外调查发现最多的一次,凸显了保护工作的紧迫性。

鳤基因组信息的缺乏一直是保护工作的重大障碍。研究团队利用PacBio和Hi-C测序数据,成功组装了鳤染色体级别的基因组,大小为883.1 Mb,包含24条假染色体,Scaffold N50长度为35.1 Mb。通过转录组测序数据,团队预测了28674个蛋白质编码基因,并将组装和注释数据公布到GenBank和Figshare数据库。

论文共同通讯作者卢建国表示:“鳤基因组信息的首次发布对于理解其遗传多样性、识别独特适应性以及制定有效的保护策略至关重要。”这一成果不仅为鳤的保护提供了科学依据,也为其他濒危物种的基因组研究提供了重要参考。

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